http://www.mplayerhq.hu/DOCS/HTML/en/edl.html Файлик в котором просто временные штампы указаны с какого по какой момент пропускать видео или делать mute на аудио. Во время проигрывания можно интерактивно этот EDL формировать и потом использовать для кодирования или при проигрывании.